代理机构代替学校申请计算机软件著作权需要盖章吗？

需要。在国家知识产权局官网查询，备案申请需要的材料和信息如下:单位与第三方机构签署双方代表签字并加盖公章的委托合同/协议扫描件；学校联系人证书照片；软件名称，版本号，代理人姓名，联系方式，所以申请计算机软件著作权需要代理机构盖章而不是学校。