我认为复制一本书的PDF文件放到网上是违法的吗？

应该是侵权的，因为虽然不是直接盈利用于下载和学习，但是大部分网站都是通过广告盈利的，知名度是吸引广告的关键因素。提供下载无疑会增加网站的受欢迎程度，从而简单地使它们更有利可图。这也是商业用途。如果是纯非营利的网站，我觉得和个人下载，学校和科研机构为了教育和研究而下载是一样的，是合理使用。