南京市商务局主要机构
组织人事部门负责业务系统干部队伍建设的宏观管理；承办机关干部管理和直属单位领导班子建设；负责人事管理、机构编制、教育培训、工资福利、人事档案管理、出国(境)人员政审和专业技术人员职称评定等工作。；指导业务系统人才队伍建设，做好相关业务技能的培训和继续教育工作；参与制定相关工种的职业资格标准、职业技能鉴定和证书发放；负责双拥工作。
办公厅组织研究开放型经济、内贸流通等商务工作中的重大问题，提出意见和建议；牵头制定业务发展战略、规划和年度工作目标计划，承担全市业务目标的监控、管理和考核；负责全市商务运行的综合统计分析和发布；牵头起草重要的业务文件和综合性文稿；协调商务领域综合改革相关工作；组织实施全市商业工作调研；负责业务系统的区域合作。
政策法规司组织起草商务领域地方性法规草案，制定工作规范和实施细则；协调商业领域相关法律、法规、条约和协定的实施；负责推进依法行政，协调全市商务领域的法律法规事务及相关工作；承担本局相关规范性文件的合法性审查及相关备案工作；承办行政复议、行政诉讼和行政执法监督；组织对法律法规实施情况的调查研究；负责行政审批制度改革；负责处理商业重组企业的政策咨询和遗留问题；承担业务系统的法制宣传教育工作。
财务部研究提出与业务工作相关的财税、金融方面的政策建议；负责局机关所辖行政经费和各类业务经费、专项经费的具体使用、管理和绩效评价；负责局机关行政经费的日常核算工作；负责局机关及直属行政单位政府采购和基础设施建设的预决算编制、财务管理、资产价值管理和资金使用；负责系统的内部审核；指导直属机构的财务工作。
行政审批服务办公室贯彻国家、省、市有关法律、法规和规章，制定并实施行政审批制度；协助推进简政放权，负责行政审批制度改革的实施；负责本部门行政许可、备案和服务事项的受理和审批；指导全区商务部门和开发区的行政审批工作；负责行政审批业务的统计和分析，定期跟踪和及时反映业务情况；承担与行政审批事项有关的其他具体工作。
招商办负责领导全市招商引资工作，拟定全市年度招商引资工作计划和招商引资相关政策；分析研究全市招商引资形势及相关动态，提出招商引资建议；负责组织协调全市国内外重大招商活动，指导相关区县和招商主体开展招商活动；负责全市投资环境的包装、宣传、营销、推广和评价工作，负责收集、汇编全市投资环境的宣传推介资料和各种电子出版物；负责境内外投资促进网络和公共服务平台建设；负责重大投资项目的全过程跟踪和推进，协调相关部门解决重大投资项目谈判和建设中出现的问题；负责投资大使和投资顾问的选拔和管理。
现代服务业发展司(服务业投资促进司)贯彻国家和省有关促进现代服务业发展的政策，跟踪研究服务业发展趋势，制定现代服务业发展战略、规划和政策；协调跟踪全市与现代服务业相关的重大投资项目，推进相关服务业集聚区和重点服务业项目建设；负责监测和分析全市现代服务业运行情况；率先推进现代物流发展和现代物流体系建设；牵头起草并组织实施商务服务业发展规划和相关激励机制；引导和支持现代新兴服务业态发展；研究提出相关行业规范和标准。
外办负责全市外贸管理工作，组织制定促进外贸稳定增长和转型升级的政策措施；指导、协调和管理全市货物进出口工作，组织实施重要工业品、原材料和重要农产品的进出口计划；负责货物进出口贸易的统计和运行分析，提出政策建议；指导和开展外贸促进活动，构建外贸促进体系，促进全市货物贸易转型升级；指导对外贸易经营者备案登记，规范对外贸易经营秩序，推进对外贸易信用体系建设；促进贸易便利化。
外资管理办公室负责指导、协调和综合管理全市外资工作，制定全市利用外资发展战略；负责推进市内外商投资企业转型升级，为市内外商投资总部、职能机构、R&D机构制定政策、推进服务；负责重点外资项目的跟踪、协调和服务；负责全市外资统计工作和外资企业经营情况分析，负责全市利用外资的综合评价、考核和奖惩；牵头组织实施全市外商投资企业联合年度报告；依法监督检查外商投资企业执行法律法规和履行合同、章程的情况；协调和指导外商投资投诉；负责指导和协调全市外商投资事中事后监管工作，推进外商投资监管体系建设。
对外投资和经济合作部贯彻国家和省有关对外投资和经济合作的政策，研究制定全市对外投资和经济合作的发展规划、政策和措施，并组织实施；管理全市对外投资(非金融)、对外承包工程、对外劳务合作和对外援助等对外经济合作业务；负责全市对外投资和经济合作的统计工作；负责组织协调全市在国内外举办的对外投资和经济合作促进活动；承担对外劳务合作管理协调小组办公室的工作，牵头处理全市境外劳务纠纷和突发事件。
开发区部门承担全市开发区的指导、服务、协调和管理工作，研究制定促进全市开发区发展的规划和政策，协调、督促有关部门、各区和开发区的实施和落实；承担省级以上经济开发区设立和撤销的审批工作；负责推进全市开发区的深化改革；协调解决全市开发区建设和发展中的重大问题，带领有关部门做好服务工作；负责全市开发区的综合统计、运行分析和考核；负责组织全市开发区参与全省开发区的综合评价。
机电技术产业处(市机电产品进出口办公室)负责指导、促进和管理全市机电和高新技术产品的进出口，制定并组织实施促进全市机电和高新技术产品进出口、优化进出口产品结构的政策措施；承担全市机电产品和高新技术产品出口体系建设和贸易促进工作；牵头推进全市先进技术设备和关键零部件进口，负责全市机电产品进出口管理，牵头推进全市加工贸易和产业转移转型升级；牵头实施全市科技兴贸战略，负责机电产品和科技兴贸创新基地的培育和推广；执行国家进出口管制政策，根据商务部和省商务厅的委托，对两用物项和技术进出口进行服务、指导和跟踪。
流通产业发展部负责流通产业管理，促进流通产业发展；率先开展内贸流通体制改革试点，深化工作，创新流通管理体制；牵头组织协调流通行业标准工作，推进流通行业流通标准化和科技进步；引导流通企业改革，积极培育大型企业集团，支持中小商业企业发展；制定促进工贸结合、农产品贸易和国内外贸易的政策措施；拟订调整和优化流通产业结构的政策并组织实施，优化商业布局和结构；牵头制定连锁经营、商业特许经营等现代流通方式发展的方针政策，并组织实施，推进流通业态和流通组织形式现代化；根据有关规定对拍卖、典当、租赁、旧货流通、免税店等特殊流通行业进行监督管理；承担融资租赁试点企业的管理工作；推动流通领域节能减排；引导再生资源回收利用；指导生产资料流通业的发展，制定相关发展规划和政策。
市场体系建设部门研究制定完善和规范市场体系的地方性法规和政策，推动建设统一开放、竞争有序的现代市场体系；组织编制和实施城市商业网点规划，研究制定城市商业网点管理办法和实施办法；研究提出引导各类资金投入市场体系建设的政策；组织实施中央、省、市财政资金安排的市场体系建设投资项目；规范大型商业项目和流通基础设施建设；统筹城乡市场协调发展，推进社区商业和农村市场体系建设；推进各类商品市场标准化建设，指导大宗产品批发市场规划，建立现代流通网络体系；推进农产品流通体系建设，制定并组织实施农产品市场规划，加强农产品市场、冷链物流等基础设施建设，发展农产品现代流通方式。监督管理汽车流通行业，负责二手车流通和旧车报废、回收、拆解、更新的监督管理；指导汽车品牌销售的管理。
市场秩序处(市菜篮子工程办公室、药品流通管理办公室)牵头协调整顿和规范商务领域市场经济秩序，参与组织打击侵犯知识产权、制售假冒伪劣商品、商业欺诈等扰乱市场秩序的行为，指导全市商务行政执法工作；推进全市商业信用体系建设，引导行业规范，建立市场诚信服务平台；负责指导全市商业信用销售，制定相关政策措施并组织实施；牵头组织和规范零售企业的促销行为，建立零售商和供应商之间的公平交易关系；承担市菜篮子工程办公室的职责，指导全市菜篮子产业发展，负责推进全市菜篮子规划和项目资金的实施和管理；负责药品流通行业管理。
市场运行与消费促进处(市酒类流通管理办公室)负责市场运行的监测、分析、预警和预测，研究提出市场运行和调控政策建议；负责重要消费品的市场监管和重要生产资料的商品流通管理；建立生活必需品应急管理机制，建立肉菜地方储备，建立小包装食品商业储存体系；协调商务领域的消费促进工作，及时提出扩大消费的政策建议；承担酒类流通管理的相关工作；制定成品油行业流通发展规划，按规定监督管理成品油流通，协调成品油市场供应，帮助推广使用绿色能源。
商务服务部(老字号保护部)负责起草全市商务服务业发展指导意见；负责餐饮、住宿、洗染、洗浴、家庭服务、美容美发、人像摄影、家电维修等生活服务业的行业管理；负责推动建立和完善家政服务体系、早餐工程等生活服务领域重点工作。制定促进老字号保护和发展的相关政策并组织实施；牵头推进老字号保护、传承和振兴，开展相关人员培训和技能交流，优化老字号发展环境；开展老字号的挖掘整理，组织“中华老字号”和地方老字号的申报认定，提升老字号知名度；推动老字号企业实施品牌战略，引导老字号企业通过连锁经营、电子商务等现代流通方式开拓市场、创新发展。
电子商务和信息化部贯彻落实国家和省关于利用电子商务开拓国内外市场的政策措施，执行电子商务相关国家标准和规范；拟定促进全市电子商务发展的规划、政策和措施，推动全市电子商务健康发展；推进电子商务平台、骨干企业、示范基地和产业园区、农村电子商务建设，支持中小企业电子商务推广应用；推动电子商务交易、网络零售、跨境贸易、电子商务服务等业态发展；建立和完善商务信息公共服务体系，开展电子商务行业统计、监测和分析；制定全市商务系统信息化建设发展规划，组织相关培训和交流；承担市跨境贸易电子商务服务试点工作领导小组办公室的具体工作。
服务贸易办公室(服务外包办)负责制定并组织实施全市促进服务贸易发展的政策、法规和战略规划；负责全市服务外包工作，制定并实施全市服务外包政策和计划；负责全市服务贸易和服务外包统计；负责全市服务贸易促进工作，推进服务贸易和服务外包公共平台建设；指导全市国际货物运输；承担涉外知识产权工作；承担市服务贸易发展联席会议办公室和市服务外包领导小组办公室的日常工作。
会展办公室负责全市会展业的统筹协调、宏观规划、综合管理、指导和促进；制定全市会展经济发展的总体规划；整合会展资源，促进会展业发展；组织引进国际国内知名品牌展会，支持和打造本土品牌展会；组织和指导国内外会展业和会展项目的推广；加强国际交流与合作，促进我市会展业的国际化发展；负责组织、策划和运营市政府主办的重大会展活动；负责在我市举办的国际、国内大型展览会的协调工作；统计、评估会展业发展状况，发布会展经济相关信息；组织和指导全市商务系统各类展会和节庆活动。
港口综合综保区办公室(电子口岸办)负责组织编制南京港口综合综保区发展规划；研究起草地方港口法规；负责口岸重大问题的调查；负责编制港口资金计划；负责港口业务的综合和统计分析；负责协调口岸查验单位的机构设置和人员编制调整方案；负责组织协调跨区域港口合作和国际交流；负责协调口岸查验单位需要当地政府解决的问题；负责组织港口文明建设；承担市综合保税区管理委员会办公室的日常事务；负责申报设立特殊监管区域，协调查验设施的规划、建设、验收和运行，推进口岸通关便利化；负责企业口岸通关的协调服务；负责协调推进“大通关”建设；负责推动电子口岸的开发应用和区域合作。
海港口岸办负责协调南京口岸开、关的审核申报和日常监管服务；负责编制相关口岸开放规划和年度计划并组织实施；负责协调相关口岸查验设施的规划和建设；负责协调相关口岸专项资金的运输；负责协调和推动国际(地区)航线和外贸内部分支机构的发展；负责推动相关口岸通关便利化；督促协调港口经营单位提供完善的执法条件和环境；参与跨区域港口合作和国际交流；参与港口规划的编制；参与口岸重大课题的调研；参与组织相关港口文明建设活动。
陆空口岸办负责协调铁路、公路、邮政、航空口岸的开闭审核申报和日常监管服务；负责相关口岸的对外开放规划和年度计划并组织实施；协调相关口岸查验设施的规划和建设；负责协调发展特种运输、国际(地区)航班和列车；负责推动相关口岸通关便利化；督促、协调港口经营单位提供完善的港口执法条件和环境；参与跨区域港口合作和国际交流；参与港口规划的编制；参与口岸重大课题的调研；参与组织相关港口文明建设活动。
外事办公室(台港澳办)参与审批全市因公出国(境)团组；协助建设和管理全市境外经贸网络；牵头联络各国政府经济部门和各经贸促进机构；负责协调和推进全市与香港、澳门特别行政区和台湾省的经贸联络和投资合作；承办本市涉商企业申请APEC商务旅行卡的相关工作；负责境内外非企业经济组织常驻南京代表机构的联络工作；承办邀请境外经贸人员来宁的相关工作；承担新加坡-南京重点项目合作委员会南京秘书处的日常工作；承担局机关和直属单位的外事管理工作。
党建工作办公室(团工委)在市委机关企事业单位党建工作中指导业务系统各单位与党的关系，负责上述单位党组织和党员管理，以及统战和知识分子工作；指导业务系统党组织的政治理论研究、思想政治工作、精神文明建设和党风廉政建设；负责学会业务系统思想政治工作的日常工作；指导业务系统的共青团工作。机关党委负责局机关党群工作。离退休干部办公室负责局机关离退休干部的服务和管理，指导直属单位的离退休干部工作。工会根据有关章程开展工作。进出口公平贸易局(产业损害调查和反垄断处)执行国家关于反倾销、反补贴和保障措施的法律、法规和政策；建立和完善预警机制，指导和协调全市出口商品贸易摩擦应对及相关工作；参与产业损害调查，做好产业安全数据报送工作；受委托依法对全市涉及的经营者集中行为进行反垄断审查并提出意见；承担世界贸易组织事务的相关工作；负责全市商业系统公平交易、产业损害调查和反垄断审查的宣传培训；承担市处理国际贸易纠纷联席会议办公室的具体工作。