什么是iclip技术？

ICLIP技术是一种高通量测序方法，用于表征RNA结合蛋白与RNA之间的相互作用。

RNA和蛋白质的相互作用位点可以用亚单核苷酸的分辨率来定义。ICLIP技术可以在细胞内通过紫外线刺激使RNA和蛋白质发生交联的位点发生交联，通过RNA免疫分离、蛋白质消化等步骤纯化RNA和结合的蛋白质。用RT-PCR扩增纯化样品中的RNA序列，用高通量测序技术对其进行测序，从而确定RNA序列和结合蛋白序列。

通过iCLIP技术，我们可以定量确定RNA序列中与蛋白质相互作用的位点，精确定位RNA剪接和编辑位点，识别与RNA调控相关的新的蛋白质结合因子。ICLIP技术可用于分析RNA与蛋白质的各种相互作用，从而揭示RNA在基因表达调控、剪接调控、RNA编辑等RNA调控中的作用机制。

中国iCLIP技术瓶颈:

核酸接头是整个iCLIP实验的核心关键物质之一。它可以从一开始就引导DNA(对应RNA)的富集，增加特定序列的数量并被检测到，最后“鱼出大海”，就像释放了一个“信号智能追踪器”。序列结尾的精确匹配和忠实锚定是其基本要求。

国内的方法是设计随机引物，总会命中某个片段。而随机引物无法连接到RNA和蛋白质的结合位点，需要专门从头设计一个接头，合成相应的DNA链，然后“打印”出RNA进行测序。

“特别设计”在一些实验中体现为预腺苷化和磷酸化，而这种“接头”在国内是没有的。事实上，在技术实力强、知识产权很多的大公司的国家，基因测序公司提供包括联合合成在内的服务，但在中国是找不到的。